“百武装展开！！” “HUNDRED”──那是能对抗袭击地球的神祕生物“蛮族”（Savage）的唯一武器。 主角如月隼人为了成为能够驾驭HUNDRED的武艺者（Slayer），进入海上学园都市舰“Little Garden”就读。
在工厂工作的18岁少年「片桐真实」，由于中途辍学而遭受周围异样的眼光，为了争一口气，他与高中落榜的妹妹「真彩」一同前往不管是谁都能就读的「函授制高中」。
在私立莉莉安女子学院，有这样一个制度，新生应该选择一个学长，两人将成为“姐妹”。在学校学习期间，姐姐会照顾并教授姐姐各方面的生活礼仪。在学院里，山百合协会的名字如雷，作为校长，小笠原和子（伊藤美由纪配音）、黑口理子（森田名美配音）和佐藤佐加（Masamuchi Keimei配音）是学院女孩们羡慕的对象。他们被称为学院的三朵玫瑰，在工作日，他们和他们的妹妹，也被称为玫瑰花蕾，负责管理学生会的规模问题。平凡的少女Fuzawa Yousi（吉田佳奈配音）阴差阳错地成为了祥子的玫瑰花蕾，同时也肩负着管理山百合俱乐部的责任。在与其他花蕾相处的过程中，一种温暖而轻松的校园生活开始了。
